2006年入退団選手

2005年ドラフト入団選手、 2006年シーズン前ドラフト外入団選手、 2005年シーズン終了後から2006年シーズン途中までの移籍入退団選手を記載しています。 ドラフト制度が大きく変更。高校生と大学生・社会人の2回行われることとなる。
高校生は甲子園のヒーロー。大阪桐蔭平田を1位指名する。
また、同じくこの年スタートの育成ドラフトで2選手を獲得した。
落合政権では不当な扱いを受けていた野口がFAで移籍退団。人的補償の小田は2番手捕手として期待がかかる。
移籍入団4人、退団6人であったが、トレードはゼロ。土谷、仲澤などの若手の見切りも目に付いた。

入団選手
第41回ドラフト会議（高校生） -2005年（平成17年）10月3日- 新高輪プリンスホテル
1巡目	平田良介	大阪桐蔭高	外野手	18歳
3巡目	春田剛	水戸短大付高	外野手	18歳
4巡目	高江洲拓哉	府中工高	投手	18歳
5巡目	金本明博	酒田南高	投手	18歳
第41回ドラフト会議（大学生・社会人） -2005年（平成17年）11月17日- 新高輪プリンスホテル
希望枠	吉見一起	トヨタ自動車	投手	21歳
3巡目	藤井淳志	ＮＴＴ西日本	外野手	24歳
4巡目	新井良太	駒大	内野手	22歳
5巡目	柳田殖生	ＮＯＭＯクラブ	内野手	24歳
6巡目	斉藤信介	ＮＴＴ西日本	投手	24歳
7巡目	佐藤亮太	国学大	投手	22歳
第41回2次ドラフト会議（育成） -2005年（平成17年）12月1日
1巡目	竹下哲史	名商大	内野手	22歳
2巡目	加藤光教	中日球団職員	投手	23歳
トレード
2005/11/10	上田佳範	← 日本ハム	外野手	32歳	自由契約
2005/11/11	デニー友利	← レッドソックス3A	投手	38歳
2005/11/14	鳥谷部健一	← 西武	投手	26歳	自由契約
2005/12/13	小田幸平	← 巨人	捕手	29歳	FA野口人的補償
退団選手
フリーエージェント
2005/11/17	野口茂樹	→ 巨人	投手	31歳
トレード
2005/10/27	大西崇之	→ 巨人	外野手	34歳	金銭
2005/10/28	森章剛	→ 日本ハム	外野手	26歳	金銭
2005/11/01	土谷鉄平	→ 楽天	外野手	23歳	金銭
2005/11/16	仲澤忠厚	→ ソフトバンク	内野手	23歳	無償
2005/11/26	田上秀則	→ ソフトバンク	捕手	26歳	自由契約